廣州中醫(yī)藥大學(xué)于1973年開辦中藥學(xué)專業(yè)，1984年成立中藥系，1997年更名為中藥學(xué)院，是國內(nèi)最早創(chuàng)立專門培養(yǎng)中藥學(xué)高級人才的院系之一。
中藥學(xué)院用于科教的總面積約4.4萬平方米，其中本科教學(xué)用場地近3萬平方米。學(xué)院有中藥學(xué)國家級實(shí)驗教學(xué)示范中心1個，國家中藥現(xiàn)代化工程中心1個，教育部國際聯(lián)合實(shí)驗室1個，廣東省重點(diǎn)實(shí)驗室2個，廣州市重點(diǎn)實(shí)驗室1個。儀器設(shè)備總值近1.5億元。近5年里，學(xué)院承擔(dān)國家和省部級科研190余項，累計科研經(jīng)費(fèi)1.3億元，以第一或通訊作者發(fā)表SCI論文367篇，獲國家專利47項，參獲國家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎二等獎1項，廣東省科學(xué)技術(shù)獎勵一等獎1項，其他省部級科學(xué)技術(shù)獎勵4項。藥理學(xué)和毒理學(xué)學(xué)科進(jìn)入ESI全球排名前1%。
學(xué)院現(xiàn)實(shí)行學(xué)部管理與運(yùn)行體制。下設(shè)中藥資源學(xué)學(xué)部、藥物化學(xué)學(xué)部、藥理學(xué)與方藥學(xué)學(xué)部、藥劑學(xué)學(xué)部。共有教職工161人，其中正高51人，副高47人，中級職稱31人。其中，博士學(xué)位74人，碩士學(xué)位47人。有博士生導(dǎo)師32人，碩士生導(dǎo)師84人，長江學(xué)者講座教授2人，海外杰青1人，國家級百千萬人才1人，全國中藥傳統(tǒng)特色技術(shù)傳承人3人，享受政府特殊津貼專家2人，珠江學(xué)者特聘教授1人，廣東省特支計劃“百千萬工程領(lǐng)軍人才”1人，廣東省“千百十工程”國家級培養(yǎng)對象1人，青年珠江學(xué)者1人，廣東省“杰青”2人，廣東省高等學(xué)校優(yōu)秀青年教師培養(yǎng)計劃培養(yǎng)對象2人，“千百十工程”省級培養(yǎng)對象6人，廣州市珠江科技新星6人。學(xué)院與美國等海外20多所知名大學(xué)建立了學(xué)術(shù)交流與合作關(guān)系，先后兼職引進(jìn)國外知名教授12名，全職引進(jìn)海外優(yōu)秀人才19名。
學(xué)院在45年的辦學(xué)歷程中，逐步形成了本科、碩士、博士多層次的人才培養(yǎng)體系。擁有中藥學(xué)一級學(xué)科學(xué)士、碩士和博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，藥學(xué)一級學(xué)科學(xué)士和碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，中藥學(xué)專業(yè)學(xué)位碩士授權(quán)點(diǎn)，學(xué)院也是中藥學(xué)博士后科研流動站。中藥學(xué)院被學(xué)校納入中醫(yī)學(xué)雙一流學(xué)科群建設(shè)單位。中藥學(xué)和藥學(xué)學(xué)科是學(xué)校高水平大學(xué)建設(shè)的2個重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科。藥學(xué)學(xué)科進(jìn)入廣州市重點(diǎn)學(xué)科建設(shè)行列。此外，中藥藥劑學(xué)、中藥藥理學(xué)和臨床中藥學(xué)是國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科。目前，學(xué)院共有全日制在校博士研究生44人，碩士研究生305人。
學(xué)院始終秉承卓越全人教育的理念，狠抓本科教育質(zhì)量。現(xiàn)有中藥學(xué)、藥學(xué)、制藥工程、中藥資源與開發(fā)四個專業(yè)，在校本科生2055人。在全院師生的共同努力下，中藥學(xué)專業(yè)和制藥工程專業(yè)為“國家特色專業(yè)”和“廣東省名牌專業(yè)”，中藥制藥專業(yè)為“國家戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)相關(guān)本科專業(yè)”，中藥資源與開發(fā)專業(yè)為“廣東省名牌專業(yè)”。學(xué)院建立了教學(xué)實(shí)踐基地49個，產(chǎn)學(xué)研合作基地31個。2018年開始，學(xué)院實(shí)施中藥學(xué)和藥學(xué)大類招生，優(yōu)化專業(yè)設(shè)置，現(xiàn)設(shè)有中藥學(xué)、藥學(xué)和制藥工程3個專業(yè)。中藥學(xué)專業(yè)在二年級分化為中藥學(xué)、中藥資源與開發(fā)專業(yè)和藥品經(jīng)營與管理專業(yè)方向。