長治醫(yī)學院生物醫(yī)學工程系成立于2000年，至今已有18年的發(fā)展歷程，為社會培養(yǎng)出應用型的畢業(yè)生近800名，積累了一定的辦學經(jīng)驗，對專業(yè)的發(fā)展有一定的研究。創(chuàng)立之初，根據(jù)我校的辦學定位和實際狀況，圍繞培養(yǎng)“有效管理醫(yī)療設施與醫(yī)學技術”的專業(yè)人才為目標，設立了辦學宗旨：“立足太行，面向基層，醫(yī)工結合，培養(yǎng)應用型生物醫(yī)學工程人才，服務于各級各類醫(yī)療衛(wèi)生機構”。經(jīng)過幾代師生的共同努力，本系各方面事業(yè)得到了快速發(fā)展，辦學成就顯著，社會聲譽良好。教學、科研、學生、黨群等工作多次榮獲校級、省級獎勵，注重實踐育人，形成創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)特色。
生物醫(yī)學工程系現(xiàn)有以下組織機構：
（一）管理組織：分團委、工會、學生會，下設黨政綜合辦公室，主要負責教學、科研、學生、黨群等日常工作；
（二）教學組織：4個教研室：工程技術教研室、電子技術教研室、信息技術教研室、醫(yī)學儀器教研室；
（三）輔助教學組織包括：2個基礎實驗室，3個專業(yè)實驗室，1個校企合作實驗室。共同承擔生物醫(yī)學工程、醫(yī)學影像學、醫(yī)學檢驗等多專業(yè)的課程教學與實驗任務。
學科建設方面，目前設立三個專業(yè)方向：醫(yī)學物理、康復器械工程、醫(yī)療設備管理維護。利用“3+1”特色培養(yǎng)醫(yī)學物理師、康復工程師、臨床工程師。
師資隊伍方面，生物醫(yī)學工程系現(xiàn)有專任教師19人，其中教授1人，副教授7人，副主任技師1人，高級工程師1人，講師4人，實驗師1人，工程師1人，助教3人。教師隊伍中具有博士學歷學位的1人，碩士學歷學位的9人，學士學歷學位的7人，有訪問學者經(jīng)歷的4人。此外，聘任有十余名校附屬醫(yī)院、國內外醫(yī)療機構與公司的實踐經(jīng)驗豐富的專家學者和工程技術人員作為兼職教授、講師，形成了一支結構合理、具有強烈學術氛圍、協(xié)作精神和創(chuàng)新精神的雙師型教學團隊。
近年來，生物醫(yī)學工程教學團隊已承擔并完成省級科學研究項目1項，省級教學研究項目3項，校級科研項目3項，教改項目5項，專業(yè)提升與綜合改革項目一項，在各級各類學術期刊以第一作者發(fā)表學術論文100余篇；指導省級大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)項目12項，校級3項。參編各種教育部、教學教材4部，省級教學成果一等獎一項，主辦電子技術類相關學術會議1次，相關專利5項。
生物醫(yī)學工程系注重理論實踐結合，創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)競賽成果顯著，形成育人特色品牌。搭建了多層次的校企合作辦學平臺，在北京、上海、重慶、深圳、沈陽等地的大型醫(yī)療器械企業(yè)，三甲醫(yī)院建立了學生實踐實訓基地。同時積極推進素質教育，學生社會實踐能力和科技創(chuàng)新能力培養(yǎng)成效突出，在全國大學生電子設計競賽、全國大學生數(shù)學建模大賽、全國生物醫(yī)學電子設計競賽等科技競賽活動中屢創(chuàng)佳績，2009至今，累計獲得國家級獎項14項，省級獎項60余項。生物醫(yī)學工程系先后為社會培養(yǎng)、輸送了一大批各級各類的優(yōu)秀人才，畢業(yè)生遍及全國各地的醫(yī)院放射科、設備科，大型醫(yī)療器械公司、研究所，醫(yī)療設備政府機構、協(xié)會等行業(yè)，表現(xiàn)出踏實肯干、動手能力強、綜合素質高等特點，受到用人單位的普遍好評。